أسست جامعة القرآن الكريم والعلوم الإسلامية لجنة الفتوى والبحوث في العام 1996م برآسة العالم الجليل الشيخ محمد علي الطريفي (رحمه الله) والشيخ البروفسور حسن أحمد حامد (رحمه الله) وعضوية عدد من العلماء الذين تعاقبوا على عضوية اللجنة  ورئاستها إلى حين صدور القرار الإداري رقم 18 لسنة 2012م بترفيعها إلى مركز البحوث الفقهية والإفتاء

المركز عبارة عن هيئة علمية متخصصة في مجال البحوث الفقهية والإفتاء تتبع لعمادة البحث العلمي والتأليف والنشر , تعمل على تحقيق أهداف الجامعة والنهضة الفكرية والعملية للأمة.