أمانة الشؤون العلمية تعتبر من الإدارات المهمة فى الجامعة، وركيزة أساسية من ركائز الجامعة، وهى تسهم اسهاما كبيرآ فى تحقيق رسالة وأهداف الجامعة عبر القنوات المتعددة من خلال تحديث وتطوير المناهج الدراسية وتقنيات التدريس الحديثة ، حيث تعمل الأمانة على التنسيق العلمى بين كليات الجامعة المختلفة والجامعات الأخرى داخل وخارج البلاد.